Кафедра Химии природных соединений
Лаборатория химии нуклеопротеидов
Состав лаборатории:
- Головина А.Я.к.х.н, научный сотрудник НИИ ФХБ им. А.Н.
Белозерского
- Донцова О.А.академик РАН, профессор, доктор химических наук
- Зверева М.Э.доцент, к.х.н
- Логвина Н.А.к.х.н., младший научный сотрудник
- Петрова О.А. соискатель
- РубцоваМ.П.с.н.с.,
к.х.н
- Сергиев П.В.доцент , доктор химических наук
- Шпанченко О. В. доктор химических наук, старший
научный сотрудник
- Скворцов Д. А. к.х.н., научный сотрудник
- Остерман И. А. к.х.н., научный сотрудник
- Сергеева О. В. к.х.н., научный сотрудник
На обучении
Основные направления исследований
(i) Изучение трансляционного аппарата
Изучение инициации трансляции и участия в ней инициаторных
факторов. Кроме
кодирующей части, мРНК содержит так называемую 5'-нетранслируемую область с
последовательностью Шайна-Дальгарно, которая отвечает за правильную посадку
инициирующей рибосомы. Соответственно, различные варианты последовательности
Шайна-Дальгарно влияют на регуляцию трансляции клеточных белков. Более того,
инициация трансляции невозможна без инициаторных факторов, роль которых на
сегодняшний день выяснена не до конца.
Обнаружение и исследование роли модификаций, которые
претерпевают РНК и белки, участвующие в трансляции. Известно большое разнообразие
различных дополнительных химических функциональных групп, которые
присоединяются к нуклеотидам и аминокислотам путем специфической модификации в
клетке, причем в бактериях очень часто за одну модификацию отвечает отдельный
фермент, соответственно клетке необходимо синтезировать множество ферментов. А
зачем клетке такие затратные процессы? Какую роль выполняет каждая из модификаций?
В рибосомных РНК насчитывается более трех десятков модифицированных
нуклеотидов, бóльшая часть из которых - метилированные. Большинство
метилированных нуклеотидов находятся в непосредственной близости от
функционально значимых центров рибосомы и влияют на эффективность и точность
прохождения различных этапов трансляции. Нас интересует, конкретная роль
некоторых модификаций нуклеотидов рРНК и белков, например, белок S6 содержит на С-конце два и более
остатков глутаминовой кислоты, которые значительно усиливают его суммарный
отрицательный заряд. Работа направлена на выяснение, каким образом, в какой
момент и зачем это происходит.
Изучение антибиотиков, действующих на рибосому. Антибиотики
подавляют рост бактерий или приводят к их смерти. Большинство из них блокируют
белковый синтез в бактериях. Известно, что бактерии способны приспосабливаться
к губительному действию таких веществ, приобретая к ним устойчивость. Данное
явление вызывает потребность поиска все новых и новых антибиотиков. Необходимо
исследовать механизмы их действия для усовершенствования их антибактериальной
активности.
(ii) Изучение теломеразы в различных организмах
Изучение структурно-функциональных особенностей теломеразы с
использованием в качестве модельной системы простейшего эукариотического
организма - дрожжей. Один из важных объектов исследований - белок Est3, необходимый участник теломеразного
комплекса дрожжей S. cerevisiae. В лаборатории были показаны новые
функции данного компонента, в частности, способность специфически расплетать ДНК-РНК
дуплексы, что позволяет предположить его непосредственное участие в обеспечении
процессивности фермента. Изучение регуляции Est3, его взаимодействия с теломерной ДНК и с теломеразой
позволит лучше понять механизм работы теломеразного комплекса на молекулярном
уровне.
Исследования теломеразы высших эукариот (в
т.ч. изучение человека). Предметом особенного интереса является регуляция
экспрессии основных компонентов теломеразы в человеческих клетках, биогенез
теломеразной РНК и альтернативные функции фермента, не связанные с синтезом
теломерной ДНК.
Поиск и создание
ингибиторов и активаторов теломеразы. Данная
работа проводится совместно с органической кафедрой химического факультета
МГУ.
Научно-исследовательские проекты и грантовая поддержка
Гранты
- грант американского
фонда CRDF (США);
- грант Медицинского
института Говарда Хьюза HHMI (HovardHugesMedicalInstitute);
- гранты Министерства
Науки и Образования РФ:
- в рамках ФЦП
"Научные и научно-педагогические кадры инновационной России"
- "Проведение
научных исследований научными группами под руководством кандидатов наук"
- в рамках ФЦП
"Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития
научно-технологического комплекса на 2007-2012 годы"
- грант Президента
Российской федерации для государственной поддержки молодых российских ученых
- гранты РФФИ
Международное сотрудничество
- Max
Planсk Institute of Biophysical Chemistry, Germany
- Max
Planck Institute for Molecular Genetics, Germany
- Institute
of Biotechnology, Lithuania
- EMBL, Germany
|